TopOntdekkers bevat doorlopende leerlijnen van groep 1 t/m 8, maar is ook vanaf groep 3 of groep 5 in te zetten. In een schooljaar worden 6 thema’s naar keuze behandeld. Deze thema’s worden schoolbreed gekozen, zodat de hele school gelijktijdig aan hetzelfde onderwerp werkt. Een thema duurt ongeveer 6 weken, waarvan 3-5 uur per week. Naast de reguliere werkvormen zijn er nieuwe verwerkingsvormen toegevoegd die het ontdekkend leren en digitale vaardigheden stimuleren. Alle leermaterialen zijn te vinden in de Portal van Kidslearning, oftewel de digitale leeromgeving. Zowel de leerling als de leerkracht kan inloggen in deze omgeving om met TopOntdekkers te werken.

Bij groep 1/2 bestaan de 12 thema’s uit 5 opdrachtkaarten met een eigen verwerkingsvorm (bijvoorbeeld kringgesprek, hoekenles, buitenactiviteit, knutselopdracht) en zijn deze thema’s leerkracht gestuurd. In groep 3 en 4 zijn er 15 opdrachtkaarten die de leerlingen per thema kunnen maken. Vanaf groep 5 kiest een leerling een opdrachtkaart op basis van onderwerp, werkvorm of groepssamenstelling. Hierbij maakt de leerling een eigen plan van aanpak en verzamelt zelf in de rijke omgeving alle benodigde informatie om deze te gebruiken voor de eindopdracht of presentatie.

Voor de groepen 1 t/m 4 zijn er binnen een opdrachtkaart drie extra opdrachten beschikbaar. Deze kunnen ingezet worden als er tijd over is, voor extra verdieping of voor het werken aan dezelfde doelen maar met een andere verwerkingsvorm dat beter aansluit bij de leerstijl van de kinderen.

Bij de groepen 5/8 vindt er differentiatie plaats op:
- Verdieping: De opdrachtkaarten zijn voor dubbele jaargroepen, voor verdieping is er een extra opdracht per opdrachtkaart.
- Onderwerp: Binnen een thema kunnen leerlingen zich meer verdiepen in specifieke onderwerpen binnen een thema. Dit mogen ze zelf kiezen. Door de intrinsieke motivatie en keuzevrijheid wordt de betrokkenheid van leerlingen vergroot.
- Groepsamenstelling: Bij elke opdrachtkaart kan de samenstelling van de groep anders zijn; individueel, in tweetal of per groep.
- Verwerking en leerstijl: Binnen de verwerking en qua leerstijl zijn er ook uiteenlopende mogelijkheden. Zo kan de eindopdracht een verslag, presentatie, vlog, mindmap of muurkrant zijn. De leerling is vrij om de verwerkingsvorm te kiezen die past bij zijn/haar leerstijl. Sommige kinderen geven voorkeur aan creatieve verwerkingen, andere kinderen een talige verwerking.
- Verdieping door onderzoek: De onderzoekscyclus zorgt ervoor dat een leerling na het verwerken van de opdracht een laag dieper leert zoeken en daarbij de belangrijke vaardigheden leert van het stellen en formuleren van een kritische onderzoeksvraag. Omdat dit in de onderbouw en middenbouw vaak nog erg lastig is, helpt het TopWerkschrift een handje door structuur aan te bieden. Het zorgt ervoor dat de plusleerling zich kan blijven ontwikkelen in een zelfregulerende setting.

Mocht er behoefte zijn naar meer uitbreiding of verdieping. Dan is er TopCanon (geschiedenis, vernieuwd sinds 2020) TopTechneut (techniek, vernieuwd sinds 2021) en TopTopo (topografiemodule, vernieuwd = sinds 2022).

Het werkschrift biedt meer structuur tijdens de TopOntdekkers lessen. Het bevat de belangrijke onderdelen: planning, onderzoekscyclus en reflectie. De leerstof van TopOntdekkers dekt de kerndoelen af. Een overzicht hiervan is te vinden in de handleiding van TopOntdekkers. TopOntdekkers kan aangevuld worden met een reflectie- en toetsmodule. Naast de beoordeling op het proces en eindproduct kan ook de kennis getoetst worden na elke opdrachtkaart. Hiervoor is een speciale reflectie- en toetsmodule ontwikkeld.