Het lesaanbod van Brandaan voor de bovenbouw is geschreven op 2 niveaus: groep 5-6 en groep 7-8. Per groep komen er 5 tijdvakken per jaar aan bod. Elk thema is verwerkt in een eigen aparte leerwerkboek, uiteraard kan het ook volledig verwerkt worden. Elk thema duurt 2 weken en telt maximaal 6 lessen. Eerst zijn er 3 reguliere lessen van 50 minuten. Deze zijn in 3 stappen opgebouwd; stap 1 nieuwsgierigheid wordt gewerkt, stap 2 kennisopbouw en stap 3 vaardigheden oefenen. Les 4 bestaat uit een samenvattingsanimatie en “test jezelf”. Daarna volgt de Uitdaging. Dit is een omvangrijke toepassingsopdracht waarin leerlingen de kennis en vaardigheden uit het thema toepassen in een concreet eindproduct. De thema’s kunnen binnen het leerjaar in een willekeurige volgorde worden aangeboden. De 8 thema’s in groep 3 en in groep 4 hebben dezelfde onderwerpen en sluiten inhoudelijk op elkaar aan. De les bevat naast het ontdekken van de wereld ook een actief doe-karakter.

De lesstof van Brandaan is op twee niveaus geschreven: groep 5-6 en groep 7-8. Het niveau van de leerlingen aan het begin van groep 5 is uiteraard anders dan het niveau van de kinderen aan het eind van groep 6. Daarom bevatten alle thema’s tempo- en niveaudifferentiatie. Bij niveaudifferentiatie wordt een hoger denkniveau aangesproken. Bij tempodifferentiatie gaat het vooral om opdrachten die te maken hebben met de vaardigheid Digitale geletterdheid. Bij deze opdrachten is daarom toegang tot internet vereist. De leerlingen kunnen zich ook onderscheiden bij de onderdelen waar een beroep wordt gedaan op de diverse vaardigheden. Vooral in de Uitdaging aan het eind van elk thema kunnen de leerlingen laten zien over welke vaardigheden en talenten ze beschikken en hoe ze deze verder ontwikkelen.

Brandaan heeft kennis, vaardigheden én het toepassen ervan op een unieke en consequente manier in de methode geïntegreerd. Dus gebeurt dit ook in de beoordeling. Per thema zijn er 2 manieren om te toetsen. Het toetsen van kennis gebeurt na les 1 tot en met 4. De toets bestaat uit 10 gesloten vragen. Hierin laten leerlingen zien wat ze weten en passen ze de geleerde kennis toe. De toets voorbereiden kan met de het onderdeel “leren voor de toets”. Daarnaast worden de vaardigheden beoordeeld. Dit gebeurt tijdens de toepassingsopdracht Uitdaging aan het eind van elk thema. De leerlingen maken deze opdracht in groepjes. Zowel het eindproduct van de Uitdaging als de samenwerking wordt beoordeeld. De leerlingen reflecteren hierbij zelf op hun werk en de leerkracht beoordeelt dit ook. Samen geven de resultaten van de thematoets en de Uitdaging een goed beeld van wat de leerling kan en op welk niveau het presteert.